В 1912 году открылась школа в селе Илтыкшин в доме Инкеева Аюу. Учителем стал Афанасий Матвеевич Ларионов, житель села Шимки. Зная хорошо бурятский язык, он обучал детей на русском и бурятском языке. Обязательным было изучение Закона Божьего.
В 1932 году усилиями колхозников колхозов «Шэнэ Ажал», «Шэнэ Илтыкшин» в селе Илтыкшин была построена начальная школа.
В послевоенные годы, когда началось укрупнение колхозов, колхозы в малых селах ликвидируются и объединяются в один колхоз имена Карла Маркса. В связи с этим, в 1949 году Илтыкшинская начальная школа переводится в с.Хужиры. Здание школы разобрали и перевезли на новое место.В 1964 году Илтыкшинская школа вошла в состав Горхонской 8-летней школы. В 1973году построено новое здание начальной школы.
В 1989 г. в жизни села, школы происходит знаменательное событие - начальная школа реорганизуется в неполную среднюю школу, которая построена усилиями совхоза «Тункинский» и жителей села. Директором школы был назначен Убушеев Владимир Жабаевич, завучем Шагдуров Владимир Дашеевич.
С 1990 года школа становится полной средней школой, а в 1992 году состоялся первый выпуск школы.
